Domenica 29 ottobre alle ore 21.00 parte la terza stagione di NCIS. Dopo che nell'ultimo episodio della seconda, purtroppo, è venuta a mancare Kate (Sasha Alexander).

Negli Stati Uniti i fans sapevano che un personaggio sarebbe morto, ma fino all'ultimo tutto è stato mantenuto nel più stretto segreto e nessuna notizia è trapelata. Quando i fans hanno scoperto vedendo l'ultima puntata della morte di Kate sono rimasti scioccati ed hanno accusato Donald Bellissario di aver licenziato Kate, ma la realtà era semplicemente che Kate aveva deciso di uscire dalla serie, perché non aveva mai partecipato ad una serie più di una stagione e non se la sentiva di continuare per una terza. La cosa può lasciare un po' perplessi ma è stato quello che ha dichiarato Sasha Alexander.
Dal punto di vista degli ascolti la terza stagione è stata un record di ascolti ed è probabile che l'uscita di Sasha Alexander abbia giovato allo share.

Dopo che Kate è stata uccisa dall'israeliano infiltrato terrorista (almeno così si pensa ma non si hanno le prove) stavolta Gibbs lo vuole morto. Perciò inizia la caccia di Ari, sperando che Gibbs lo faccia fuori! una volta per sempre!

Tra le novità della terza stagione ci sono due nuove attrici che entrano nel cast fisso della serie nel corso della terza stagione:
- Lauren Holly che interpreta il Direttore dell'NCIS Jennifer "Jenny" Shepard e
- la sostituta di Kate: l'agente Ziva David interpretata da Cote de Pablo.

Gli episodi in onda sono due episodi unici, divisi in prima e seconda parte. Negli Stati Uniti sono andati in onda separatamente.
Titolo degli episodi: 3.01/3.02 - Kill Ari